23 septembre
Par
Le
Dans importation de données, sig - cartographie
Avec 0 Commentaire

Un raster est un fichier géographique dont les données sont stockées sous forme d’une grille régulière. Il existe plusieurs format de stockage : GeoTiff, netcdf, asc, …  Dans R, il existe 3 packages principaux qui peuvent vous permettre de lire un fichier raster : l’historique : {raster} la version remastérisée avec du C++ : {terra} un package récent avec une philosophie différente : {stars} Lecture d’un fichier raster avec une seule couche # récupération du chemin d’un Geotifftif <- system.file(« tif/L7_ETMs.tif », package = « stars ») # lecture avec {raster}r_raster <- raster(tif)# lecture avec {terra}r_terra <- rast(tif)# lecture avec {stars}r_stars <- read_stars(tif) Lecture d’un fichier raster avec plusieursRead More →

01 novembre
Par
Le
Dans importation de données
Avec 0 Commentaire

Avec R, il est tout à fait possible de réaliser une multiple importation des fichiers CSV (autres types de fichiers). La fonction ci-dessous utilise les fonctions bind_rows et la syntaxe de la librairie dplyr. multmerge <- function(mypath = getwd()){ require(dplyr) dataset <- list.files(path=mypath, full.names=TRUE, pattern= »\.csv ») %>% lapply(read.csv, header=TRUE, sep= »t ») %>% bind_rows() dataset } Dans cette fonction, l’objet mypath indique l’emplacement où se trouve tous les fichiers CSV. Par défaut, la fonction va chercher dans l’espace de travail actuel (getwd). Il est possible de le modifier manuel comme ci-dessous:  mydata <-  multmerge(mypath= »Nom/Du/Chemin/Des/Fichiers »)Read More →

18 juillet
Par
Le
Dans importation de données
Avec 0 Commentaire

Pour importer un fichier SAS sas7bdat, la premiere solution est d’utiliser la fonction read.sas7bdat du package sas7bdat library(sas7bdat)donnee<-read.sas7bdat(« fichier.sas7bdat ») Cependant parfois  vous allez tomber sur cette erreur : Error in read.sas7bdat(« ficher.sas7bdat ») : file contains compressed data En effet le package sas7bdat n’est pas capable d’importer les fichiers compressés.Voici une solution qui fonctionne : library(devtools)install_github(« biostatmatt/sas7bdat.parso »)library(sas7bdat.parso) s7b2csv(« fichier.sas7bdat », « fichier.csv ») donnee<-read.csv(« fichier.csv »)  Read More →

03 juin
Par
Le
Dans importation de données
Avec 1 Commentaire

L’import de fichier Excel dans R a toujours été un peu laborieuse, plusieurs façons de faire plus ou moins compliquées. Une fonction sort du lot readWorksheetFromFile du package XLconnect library(XLConnect) dataset<-readWorksheetFromFile(file="http://www.euklems.net/data/nace2/fra_output_12i.xlsx ", sheet=3) head(dataset)Read More →

14 novembre
Par
Le
Dans exportation de données, importation de données
Avec 0 Commentaire

Le couple save et load a l’inconvénient de forcer le nom de l’objet que vous voulez charger.Exemple : si vous avez enregistré la variable « a » qui vaut 3 grace à save, load vous donnera une variable « a » qui vaut 3, mais vous n’allez pas pouvoir charger cette variable dans un autre objet, et cela écrasera votre variable « a » d’origine. rm(list=ls(all=TRUE)) a<-5 save(a,file= »fichier ») a<-3 load(« fichier ») a # a vaut maintenant 5 , et avec load et save il n’est pas possible de charger ce 5 dans une autre variable pour « sauvegarder » votre 3 dput et dget permettent de stocker un objet dans un fichier et deRead More →

08 novembre
Par
Le
Dans importation de données
Avec 1 Commentaire

Pour charger un fichier excel vous avez 3 façons de faire 1 Vous pouvez utiliser Rcmdr library(Rcmdr) # puis importer des données.. ça marche plutôt bien.. mais que sous windows En pratique Rcmdr utilise le package RODBC.Je le trouve peu intuitif en ligne de commande et vous propose d’utiliser le package xlsReadWrite 2 Le package xlsReadWrite library(xlsReadWrite)xls.getshlib() # indispensabledonnee<-read.xls(« data.xls ») Par contre cela ne marche jamais vraiment parfaitement bien lorqu’il y a des onglets ou pour des cas un peu spéciaux. Il existe une version pro, payante de ce package qui utilise des fichiers binaires propriétaires, mais il serait dommage d’utiliser cela. J’en arrive donc auRead More →