Une anova avec modèle mixte comme VARCOMP dans SAS Créons d’abord un jeu de données. On souhaite déterminer la précision et la répétabilité d’une analyse. Pour cela, la mesure est effectuée par 2 techniciens différents, sur des concentrations de produits différents sur 3 jours différents et avec 2 réplicats. library(dplyr) set.seed(42) data <- tibble( concentration = rep(c(10, 30, 50, 80), 3*2), technicien = rep(c(« A », « B »), each = 3*2*2), jour = rep(rep(1:3, each = 2*2), 2), replicat = rep(1:2, times = 2*3*2)) %>% mutate(mesure = ifelse( technicien == « A », 0.2 * concentration + rnorm(12, sd = 3), 0.2 * concentration + rnorm(12, sd = 2))) dataRead More →

Qui sommes-nous ? L’adresse de notre site Web est : https://thinkr.fr/abcdr. Utilisation des données personnelles collectées Commentaires Les commentaires sont gérés par Disqus. Quand vous laissez un commentaire sur notre site web, les données inscrites dans le formulaire de commentaire, mais aussi votre adresse IP et l’agent utilisateur de votre navigateur sont collectés pour aider à la détection des commentaires indésirables. Leur politique de confidentialité se trouve sur cette page : https://help.disqus.com/terms-and-policies/disqus-privacy-policy Médias Si vous êtes un utilisateur ou une utilisatrice enregistré·e et que vous téléversez des images sur le site web, nous vous conseillons d’éviter de téléverser des images contenant des données EXIF de coordonnées GPS.Read More →

Une opération courante quand on travaille avec des variables qualitatives (de type factor ou character) est de modifier les valeurs des modalités de cette variable. Ceci permet de les rendre plus courtes, plus explicites, ou même de les regrouper si on leur attribue le même nom. La fonction fct_recode, de l’extension forcats (qui fait partie du tidyverse) facilite ce type d’opérations. Celle-ci prend en premier argument un vecteur, puis une série de recodages sous la forme Nouvelle valeur = Ancienne valeur. Exemple : library(forcats) f <- c(« Fraise », « Framboise », « Pomme », « Fraise ») f <- fct_recode(f, « Ananas » = « Fraise », « Poire » = « Pomme ») f [1] Ananas Framboise Poire AnanasRead More →

Une opération courante quand on travaille avec des variables qualitatives (de type factor ou character) est de modifier les valeurs des modalités de cette variable. Ceci permet de les rendre plus courtes, plus explicites, ou même de les regrouper si on leur attribue le même nom. La fonction fct_recode, de l’extension forcats (qui fait partie du tidyverse) facilite ce type d’opérations. Celle-ci prend en premier argument un vecteur, puis une série de recodages sous la forme Nouvelle valeur = Ancienne valeur. Exemple : library(forcats) f &lt;- c(&quot;Fraise&quot;, &quot;Framboise&quot;, &quot;Pomme&quot;, &quot;Fraise&quot;) f &lt;- fct_recode(f, &quot;Ananas&quot; = &quot;Fraise&quot;, &quot;Poire&quot; = &quot;Pomme&quot;) f [1] Ananas Framboise Poire AnanasRead More →

Pour proposer un article sur ce site Internet, nous passons par notre compte Github ThinkR-open/abcdR. Vous devrez faire un fork de notre dépôt github, ajouter un article au format markdown dans le dossier _post et proposer une pull request. Les articles au format markdown (.md) devront avoir Le fichier doit avoir l’extension .md (il sera renommé automatiquement au moment du push) L’en-tête YAML suivante: — post_title: Titre de votre article author: votre_nom_d_auteur layout: post published: true categories: – graphique – tidyverse — Le contenu de votre article vient ici. le code R doit etre mis en forme comme cela : (…) le code R doitRead More →

Pour proposer un article sur ce site Internet, nous passons par notre compte Github ThinkR-open/abcdR. Vous devrez faire un fork de notre dépôt github, ajouter un article au format markdown dans le dossier _post et proposer une pull request. Les articles au format markdown (.md) devront avoir Le fichier doit avoir l’extension .md (il sera renommé automatiquement au moment du push) L’en-tête YAML suivante: — post_title: Titre de votre article author: votre_nom_d_auteur layout: post published: true categories: – graphique – tidyverse — Le contenu de votre article vient ici. le code R doit etre mis en forme comme cela : (…) le code R doitRead More →

R est un logiciel libre, gratuit et multiplateforme (windows, linux et mac) distribué par GNU Public Licence trés utilisé pour l’analyse statistique. La version de base dispose d’un grand nombre d’outils analytiques et graphiques permettant de manipuler, de traiter et de représenter des données de nature très différentes. Son développement met à contribution des utilisateurs qui peuvent créer de nouveaux paquets (« packages ») rendant les possibilités d’utilisation immenses dans des domaines d’études très différents (écologie, analyse sensorielle, psychologie, économie…) et faisant intervenir des techniques très diverses (analyse multivariée, modélisation linéaire et non linéaire, statistique spatiale, classification, tests statistiques…). Le partage grandissant de nouveaux paquetsRead More →

Un shapefile est un fichier d’information géographique avec un format vectoriel. Il permet de représenter des points (e.g. villes), des lignes (e.g. routes) et des polygones (e.g. départements) avec un système d’information géographique. Le format shapefile est composé de plusieurs fichiers séparés (4 minimum): data.shp : informations de géométrie (coordonnées) data.prj : information de système de projection data.dbf : table des attributs data.shx : indice de position des géométries Dans R, deux packages majeurs sont utilisés pour manipuler les données géographiques de type vectoriel: {sp} : Le package de référence. Il utilise notamment la librairie {rgdal} pour lire les données géographiques, un package utilisant laRead More →

Un shapefile est un fichier d’information géographique avec un format vectoriel. Il permet de représenter des points (e.g. villes), des lignes (e.g. routes) et des polygones (e.g. départements) avec un système d’information géographique. Le format shapefile est composé de plusieurs fichiers séparés (4 minimum): data.shp : informations de géométrie (coordonnées) data.prj : information de système de projection data.dbf : table des attributs data.shx : indice de position des géométries Dans R, deux packages majeurs sont utilisés pour manipuler les données géographiques de type vectoriel: {sp} : Le package de référence. Il utilise notamment la librairie {rgdal} pour lire les données géographiques, un package utilisant laRead More →

Il s’agit d’un des formats de graphiques les plus populaires : le barplot est simple à réaliser, encore plus avec ggplot2. Du moins, si l’on connait ses spécificités. Package du tidyverse, {ggplot2} est un outil de visualisation ultra célèbre parmi les utilisateurs de R. Et pour cause, même si sa syntaxe peut surprendre à première vue, les résultats obtenus sont haut-de-gamme. Alors, comment réaliser un barplot ? Tout simplement avec le geom geom_bar(). À noter que vous pouvez l’utiliser pour deux formats de barplots, qui demandent chacun d’adapter votre code. Pour compter les occurences d’une variable, vous avez besoin de seulement spécifier en x laRead More →