Ce message apparaît lorsque l’on essaye de lancer un script initialement écrit sous windows sur une station linux (et inversement).
Il s’agit d’un souci d’encodage.

il est possible de corriger cela grâce au script suivant (remplacer latin1 par l’encodage d’origine du fichier)

options(encoding="latin1")

Ou alors

options(encoding="utf-8")