Comment recoder les modalités d’une variable qualitative ?

Une opération courante quand on travaille avec des variables qualitatives (de type factor ou character) est de modifier les valeurs des modalités de cette variable. Ceci permet de les rendre plus courtes, plus explicites, ou même de les regrouper si on leur attribue le même nom.

La fonction fct_recode, de l’extension forcats (qui fait partie du tidyverse) facilite ce type d’opérations. Celle-ci prend en premier argument un vecteur, puis une série de recodages sous la forme Nouvelle valeur = Ancienne valeur.

Exemple :

library(forcats)
f <- c("Fraise", "Framboise", "Pomme", "Fraise")
f <- fct_recode(f,
                "Ananas" = "Fraise",
                "Poire" = "Pomme")
f

[1] Ananas    Framboise Poire     Ananas   
Levels: Ananas Framboise Poire

Pour regrouper des modalités il suffit de leur attribuer la même valeur :

f <- c("Fraise", "Framboise", "Pomme", "Fraise")
f <- fct_recode(f,
                "Fruit rouge" = "Fraise",
                "Fruit rouge" = "Framboise")
f

[1] Fruit rouge Fruit rouge Pomme       Fruit rouge
Levels: Fruit rouge Pomme

À noter que si on veut recoder une valeur en NA, il faut lui attribuer (de manière peu intuitive) la valeur NULL :

f <- c("Fraise", "Framboise", "Pomme", "Fraise")
f <- fct_recode(f,
                "Fruit rouge" = "Fraise",
                "Fruit rouge" = "Framboise",
                NULL = "Pomme")
f

[1] Fruit rouge Fruit rouge <NA>        Fruit rouge
Levels: Fruit rouge

À l’inverse, si on veut transformer des NA en une valeur explicite, on doit le faire à l’aide la fonction fct_explicit_na :

f <- c("Fraise", "Framboise", "Pomme", "Fraise", NA)
f <- fct_explicit_na(f, "NR")
f

[1] Fraise    Framboise Pomme     Fraise    NR       
Levels: Fraise Framboise Pomme NR

À noter que toutes ces opérations sont sensibles à la casse (majuscules/minuscules), aux accents, aux espaces, etc. Il faut donc recopier exactement à l’identique les noms des anciennes valeurs.

À noter également que l’extension questionr propose un petit addin (interface graphique ponctuelle) pour faciliter la génération du code du recodage d’une variable qualitative.

forcats propose par ailleurs de nombreuses autres fonctions utiles pour travailler avec les variables qualitatives.